VDU rektoriumi penkerių metų kadencijai išrinktas iki šiol universitete Mokslo prorektoriaus pareigas ėjęs matematikas, habilituotas technologijos mokslų daktaras, Lietuvos mokslų akademijos tikrasis narys (akademikas) prof. Juozas Augutis. Taryba patvirtino ir naują prorektorių komandą. Universitetui prof. J. Augutis vadovauja jau nuo liepos 1 d. Mokslininkas yra jau šeštasis Vytauto Didžiojo universiteto rektorius nuo jo atkūrimo 1989 m.
Ankstesnieji atkurtojo VDU rektoriai buvo: prof. Jurgis Vilemas (Atkūrimo tarybos sprendimu, 1989–1990 m.), prof. Algirdas Avižienis (1990–1993 m.), prof. Bronius Vaškelis (1993–1996 m.), prof. Vytautas Kaminskas (1996–2006 m., dvi kadencijas). 2006–2015 m. dvi kadencijas iš eilės VDU rektoriaus pareigas ėjo ekonomistas, habilituotas socialinių mokslų daktaras, prof. Zigmas Lydeka.
Juozas Augutis 1978 m. baigė Vilniaus universiteto Matematikos ir mechanikos fakultetą, 1986 m. VU apgynė matematikos mokslų kandidato disertaciją. Nuo 1990 m. VDU dirbo Matematikos katedros docentu, nuo 2002 m. – Matematikos ir statistikos katedros profesorius. 2002 m. suteiktas technologijos mokslų habilituoto daktaro laipsnis. Trylika metų (1993–2006 m.) vadovavo VDU Studentų reikalų tarnybai. Nuo 2006-ųjų ėjo VDU Mokslo prorektoriaus pareigas, o nuo 2009 m. vadovauja VDU ir Lietuvos energetikos instituto Energetinio saugumo tyrimų centrui, taip pat yra universiteto Senato ir Tarybos narys.